Atlas molecular de Trigo

Atlas
Molecular
de Trigo

Navegando la diversidad genética

Entendiendo y usando la Diversidad

El atlas molecular proporciona datos, herramientas y recursos que permiten a los usuarios del banco de germoplasma; mejoradores de trigo, investigadores, agentes de extensión, etc., identificar la diversidad con un posible valor para sus necesidades específicas a partir de las decenas de miles de razas nativas disponibles para ellos.

El atlas está estructurado en torno de tres pilares; datos y conocimiento, herramientas y recursos para capacitación. Los componentes específicos dentro de estos pilares se pueden acceder solos o en combinación, según lo requieran los usuarios, como se ilustra en el ejemplo de identificación de una nueva variación para la tolerancia al calor.

Estamos interesados en recibir sus comentarios sobre el atlas molecular. Por favor, siéntase libre de contactarnos para hacer preguntas o proporcionar comentarios.

DATOS, CONOCIMIENTO Y RECURSOS PARA CAPACITACIÓN

SeeD Germinate Trigo es una base de datos de recursos genéticos que almacena y proporciona herramientas de búsqueda y visualización de datos de pasaportes, información y datos de la colección de accesiones, datos genotípicos y fenotípicos de las accesiones de Trigo y materiales derivados estudiados como parte de la iniciativa. Germinate fue desarrollado por el Instituto James Hutton, en colaboración con el CIMMYT.

El Dataverse de CIMMYT-Seeds of Discovery es un repositorio de datos y softwares que contiene archivos de datos, conocimientos y recursos de capacitación proporcionados en un formato estructurado y descargable.

HERRAMIENTAS INFORMATICAS

Flapjack es una aplicación multiplataforma que permite la visualización gráfica de genotipos y haplotipos simples y complejos utilizando datos de marcadores SNPs (polimorfismos de un único nucleótido). Flapjack permite la representación de QTL y la clasificación de muestras por fenotipo. Flapjack fue desarrollado por el Instituto James Hutton, en colaboración con CIMMYT.

CurlyWhirly es una aplicación multiplataforma desarrollada que permitir la visualización interactiva del análisis multivariado, con un enfoque particular en los resultados del Análisis de Coordenadas Principales, Análisis de Componentes Principales, Análisis Canónico y Escalamiento Multidimensional. La integración de resultados con otros datos categóricos facilita la interpretación y la selección de puntos de interés. CurlyWhirly fue desarrollado por el Instituto James Hutton, en colaboración con CIMMYT.

KDSmart es una aplicación digital, en plataforma Android, que facilita la toma de datos fenotípicos en campo, invernadero o laboratorio, mediante una tableta o teléfono inteligente. KDSmart fue desarrollado por Diversity Arrays Technology (DArT) en colaboración con CIMMYT.

KDXplore es una aplicación multiplataforma que ayuda a administrar y gestionar la calidad de los datos recopilados por KDSmart en viveros, pruebas de rendimiento, producción y campos de observación. KDXplore fue desarrollado por Diversity Arrays Technology (DArT) en colaboración con CIMMYT.

RECURSOS PARA CAPACITACIÓN

El Dataverse de CIMMYT-Seeds of Discovery es un repositorio de datos y softwares que contiene archivos de datos, conocimientos y recursos para capacitación proporcionados en un formato estructurado y descargable.

ENLACES CON OTROS RECURSOS DE TRIGOS

Somos conscientes de que SeeD es solo uno de varios proyectos y recursos en línea que se ocupan de la diversidad genética del Trigos o datos moleculares. A medida que desarrollemos el Atlas Molecular de Trigo, intentaremos vincularlo con otros recursos y proyectos en línea, como, por ejemplo: