Tools: META-R (Multi Environment Trail Analysis with R for Windows) » Seeds of Discovery

NOVEDADES

Colaboran Agricultura y CIMMYT en mejorar las variedades de maíz, con mayor resistencia al clima, plagas y enfermedades
El Atlas Molecular del Maíz es uno de los trabajos científicos más relevantes de la actualidad, con lo cual se han caracterizado más de 42 mil muestras de maíz (incluyendo 24 mil de maíces nativos) y se han generado más de 50 billones de datos útiles para encontrar variedades resistentes a calor, sequía, plagas y enfermedades. NÚM. 374 / Ciudad de México El Atlas Molecular del Maíz es uno de los trabajos científicos más relevantes de la actualidad, con lo cual se han caracterizado más de 42 mil muestras de maíz (incluyendo 24 mil de maíces nativos) y se han generado más ...
Taller "Fenotipificación de trigo"
El Centro Internacional de Mejoramiento de Maíz y Trigo (CIMMYT) extiende una cordial invitación para participar en el taller de “Fenotipificación de trigo para la identificación de germoplasma con alto potencial de rendimiento y tolerancia a sequía y calor”, a realizarse en el marco del II Plant Breeding Symposium México ( https://trasmejoragen.wixsite.com/inicio) 2018 en CIMMYT, Texcoco, Estado de México, el día 28 de septiembre de 2018 a las 9:00 hrs. (De 9:00 a 14:00 hs) El objetivo de este taller es capacitar a los participantes en la caracterización fenotípica del germoplasma de trigo. Los ejes temáticos son: cambio climático, características prioritarias ...
II Plant Breeding Symposium México 2018
MasAgro Biodiversidad anuncia el II Plant Breeding Symposium México 2018 el cual se llevará a cabo los días 6 y 7 de septiembre de 2018 en las instalaciones de CIMMYT, Texcoco. México. Este evento pertenece a la serie de simposios organizados por DuPont Pioneer. Para mayor información por favor visite el sitio web: https://trasmejoragen.wixsite.com/inicio
Convocatoria Investigación MasAgro para análisis genético
En el marco del programa de Modernización Sustentable de la Agricultura Tradicional (Programa MasAgro), desarrollado por la Secretaría de Agricultura y Desarrollo Rural (SADER), y a través de su línea de acción MasAgro Biodiversidad liderada por el Centro Internacional de Mejoramiento de Maíz y Trigo (CIMMYT) el cual tiene como uno de sus objetivos el aprovechamiento de los recursos genéticos valiosos, mediante tecnologías de punta y desarrollo de capacidades, para acelerar el desarrollo (la obtención) de variedades de maíz y trigo de alto rendimiento, estables y tolerantes al cambio climático. Una de las actividades contempladas es la difusión de los ...

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Catalogo

CATALOGO DE PRODUCTOS

CATALOGO DE PRODUCTOS

MasAgro Biodiversidad, un componente del programa Modernización Sustentable de la Agricultura Tradicional (MasAgro), se enfoca en el aprovechamiento y conservación de recursos genéticos valiosos mediante el uso de la diversidad genética resguardada en los bancos de germoplasma, con el propósito de acelerar el desarrollo de variedades de maíz y trigo que puedan satisfacer la demanda alimenticia y nutricional de una población creciente, ante los desafíos del cambio climático.

Mediante la caracterización de la configuración genética de las colecciones del banco de germoplasma del CIMMYT, la evaluación de características prioritarias – como la tolerancia a sequía, altas temperaturas y algunas enfermedades – y el desarrollo de herramientas de bioinformática que agilizan su análisis, MasAgro Biodiversidad ha generado una “plataforma para la utilización de recursos genéticos” de maíz y trigo.

Esta plataforma pone varios productos a disposición de la comunidad científica. MasAgro Biodiversidad además ofrece algunos servicios con la finalidad de promover la equidad en el acceso y beneficios del uso de la diversidad del maíz y el trigo.

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META-R (Análisis de ensayos múltiples de ambiente con R para Windows)

META-R es un conjunto de programas en R que realiza análisis estadísticos para calcular BLUEs, BLUPs, correlaciones genéticas entre ubicaciones y correlaciones genéticas entre variables, heredabilidad en sentido amplio y otras estadísticas para ensayos de mejoramiento, para hacer gráficos de caja e histogramas.

Detalles del producto y características

Los análisis se pueden realizar por ubicación, a través de las condiciones de manejo o en todas las ubicaciones.

META-R contiene una interfaz gráfica de JAVA que ayuda al usuario a elegir fácilmente archivos de entrada, qué análisis implementar y qué variables analizar.

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Versión actual: 6.01

Disponibilidad

Disponible públicamente en el repositorio de programas y datos de investigación del CIMMYT: https://data.cimmyt.org/dataset.xhtml?persistentId=hdl:11529/10201

Usuarios Principales

Mejoradores, investigadores y estudiantes interesados en análisis estadísticos para diferentes propósitos

Para más información

Por favor envíenos un mensaje a Cimmyt-mab-seed@cgiar.org

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CARTERA DE INVESTIGACIÓN

CARTERA DE INVESTIGACIÓN

Recursos genéticos

Desarrollo de capacidades

Datos

Germoplasma de pre-reproducción

Conocimiento

Software

FILOSOFÍA DE NUESTRO ENFOQUE

FILOSOFÍA DE NUESTRO ENFOQUE

¡Tantas accesiones, tan pocos datos!

Muchos bancos de germoplasma se asemejan a bibliotecas que carecen de catálogos suficientemente informativos. El avance de las plataformas de secuenciación de ADN de siguiente generación ha permitido caracterizar la diversidad genética conservada en bancos de germoplasma completos.

Gestión de la información

Generar nuevos datos por sí mismo es insuficiente si no pueden ser difundidos, consultados, resumidos, visualizados y analizados de manera efectiva. La generación de datos, por lo tanto, tiene que ir de la mano con el suministro de programas computacionales intuitivos y herramientas de análisis para hacer frente a la rápida expansión de datos que describen los recursos genéticos de maíz y trigo.

Pre-mejoramiento

Un “re arreglo” de la diversidad de los bancos de germoplasma en un formato más accesible para los mejoradores podría reducir las barreras para movilizar nuevas variaciones genéticas en programas de mejoramiento, que en buena parte se deben a la dependencia de los efectos génicos en la dotación genética de los diferentes materiales a mejorar.

Rasgos con arquitectura genética compleja

Algunos de los desafíos más importantes para la agricultura deben ser abordados manipulando caracteres genéticamente complejos controlados por alelos de efecto menor (potencial de rendimiento, tolerancia al calor y sequía, etc.).

Recolección de germoplasma

La disponibilidad de un número suficiente de accesiones en los bancos de germoplasma no parecen ser un factor que limite el uso de nuevas variaciones genéticas en los programas de mejoramiento y una nueva iniciativa garantizará la red global de bancos de germoplasma de los principales cultivos alimentarios para las generaciones futuras.