NOVEDADES

  • Colaboran Agricultura y CIMMYT en mejorar las variedades de maíz, con mayor resistencia al clima, plagas y enfermedades

    El Atlas Molecular del Maíz es uno de los trabajos científicos más relevantes de la actualidad, con lo cual se han caracterizado más de 42 mil muestras de maíz (incluyendo 24 mil de maíces nativos) y se han generado más de 50 billones de datos útiles para encontrar variedades resistentes a calor, sequía, plagas y enfermedades. NÚM. 374 / Ciudad de México El Atlas Molecular del Maíz es uno de los trabajos científicos más relevantes de la actualidad, con lo cual se han caracterizado más de 42 mil muestras de maíz (incluyendo 24 mil de maíces nativos) y se han generado más ...

  • Taller "Fenotipificación de trigo"

    El Centro Internacional de Mejoramiento de Maíz y Trigo (CIMMYT) extiende una cordial invitación para participar en el taller de “Fenotipificación de trigo para la identificación de germoplasma con alto potencial de rendimiento y tolerancia a sequía y calor”, a realizarse en el marco del II Plant Breeding Symposium México ( https://trasmejoragen.wixsite.com/inicio) 2018 en CIMMYT, Texcoco, Estado de México, el día 28 de septiembre de 2018 a las 9:00 hrs. (De 9:00 a 14:00 hs) El objetivo de este taller es capacitar a los participantes en la caracterización fenotípica del germoplasma de trigo. Los ejes temáticos son: cambio climático, características prioritarias ...

  • II Plant Breeding Symposium México 2018

    MasAgro Biodiversidad anuncia el II Plant Breeding Symposium México 2018 el cual se llevará a cabo los días 6 y 7 de septiembre de 2018 en las instalaciones de CIMMYT, Texcoco. México. Este evento pertenece a la serie de simposios organizados por DuPont Pioneer. Para mayor información por favor visite el sitio web: https://trasmejoragen.wixsite.com/inicio

  • Convocatoria Investigación MasAgro para análisis genético

    En el marco del programa de Modernización Sustentable de la Agricultura Tradicional (Programa MasAgro), desarrollado por la Secretaría de Agricultura y Desarrollo Rural (SADER), y a través de su línea de acción MasAgro Biodiversidad liderada por el Centro Internacional de Mejoramiento de Maíz y Trigo (CIMMYT) el cual tiene como uno de sus objetivos el aprovechamiento de los recursos genéticos valiosos, mediante tecnologías de punta y desarrollo de capacidades, para acelerar el desarrollo (la obtención) de variedades de maíz y trigo de alto rendimiento, estables y tolerantes al cambio climático. Una de las actividades contempladas es la difusión de los ...

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Catalogo

CATALOGO DE PRODUCTOS

CATALOGO DE PRODUCTOS

MasAgro Biodiversidad, un componente del programa Modernización Sustentable de la Agricultura Tradicional (MasAgro), se enfoca en el aprovechamiento y conservación de recursos genéticos valiosos mediante el uso de la diversidad genética resguardada en los bancos de germoplasma, con el propósito de acelerar el desarrollo de variedades de maíz y trigo que puedan satisfacer la demanda alimenticia y nutricional de una población creciente, ante los desafíos del cambio climático.

Mediante la caracterización de la configuración genética de las colecciones del banco de germoplasma del CIMMYT, la evaluación de características prioritarias – como la tolerancia a sequía, altas temperaturas y algunas enfermedades – y el desarrollo de herramientas de bioinformática que agilizan su análisis, MasAgro Biodiversidad ha generado una “plataforma para la utilización de recursos genéticos” de maíz y trigo.

Esta plataforma pone varios productos a disposición de la comunidad científica. MasAgro Biodiversidad además ofrece algunos servicios con la finalidad de promover la equidad en el acceso y beneficios del uso de la diversidad del maíz y el trigo.

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  • Datos Genotípicos de Maíz


    El proyecto Seeds of Discovery ha generado varios tipos de datos genotípicos describiendo germoplasma de maíz, incluyendo accesiones del Banco de Germoplasma del CIMMYT (BGC) y materiales de pre-mejoramiento generados a partir de materiales del BGC. Los tipos de datos incluyen polimorfismos de un solo nucleótido (SNP), variaciones de presencia/ausencia (PAV) y frecuencias de alelos para miles de marcadores. Los datos disponibles son liberados como “conjuntos de datos” para grupos de germoplasma y/o marcadores.

    Detalles del producto y características

    En general, se liberan datos genotípicos de alta densidad (con más de un millón de marcadores por muestra) a través de Dataverse, mientras que las frecuencias alélicas y los conjuntos de datos de SNP de densidad más baja suelen liberarse a través de Germinate.

    Conjuntos de datos genotípicos en Dataverse:

    1. Está disponible una lista de los conjuntos de datos genotípicos, disponibles para descarga del repositorio de Dataverse, enlazados a estudios individuales.Link
    2. Los estudios contienen archivos de datos estáticos, incluyendo archivos de resultados genotípicos, y archivos de apoyo, como archivos de mapeo para vincular nombres de muestras de ADN con identificadores de germoplasma (GID), protocolos de extracción o análisis u otros documentos relevantes.
    3. Cada estudio está documentado con metadatos estándares, incluyendo: nombre del estudio, descripción, autores, generador(es) de datos, fecha de generación, palabras clave, enlaces a estudios relacionados, enlaces a artículos científicos relevantes.

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  • Conjuntos de datos genotípicos en Germinate:

    1. Está disponible una lista de los conjuntos de datos genotípicos disponibles en Germinate con enlaces a conjuntos de datos individuales. Estos se separan en grupos de datos genotípicos generales (SNPs y PAVs) y grupos de datos genotípicos basados en frecuencias alélicas.Link
    2. Los usuarios deben primero iniciar una sesión en Germinate, después de registrarse de forma gratuita y aceptar los términos de la licencia de transferencia de datoses.
    3. Se pueden generar “Grupos” de germoplasma o marcadores de interés utilizando una o más herramientas de búsqueda o filtrado, y utilizarlos inmediatamente para generar subconjuntos de datos personalizados y/o guardarlos para uso futuro.

    1. Los grupos de datos genotípicos SNP en Germinate están disponibles para su descarga directa en un formato de matriz simple.
    2. Los usuarios pueden elegir exportar posiciones de marcador basadas en mapas físicos o genéticos específicos
    3. Los usuarios pueden descargar los datos genotípicos elegidos en un formato de texto o como “Proyecto” inmediatamente disponibles para su visualización en el software Flapjack.

    Usuarios principales

    Investigadores, estudiantes que trabajan en campos relevantes como biología, mejoramiento y bioinformática, así como mejoradores de maíz, mejoradores moleculares, curadores de bancos de germoplasma y usuarios de materiales del banco de germoplasma del CIMMYT.

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  • Comentarios

    Algunos de los conjuntos de datos genotípicos, especialmente los datos de muy alta densidad disponibles en Dataverse, son de gran tamaño y pueden requerirse largos períodos de tiempo para descargarlos, especialmente para personas que tienen una conexión limitada a Internet.

    Los datos se pueden proporcionar de maneras alternativas si la transferencia directa por Internet no es posible.Los tamaños de archivo grandes también pueden hacer que sea difícil, o incluso imposible, trabajar con ellos en equipos con memoria limitada.

    Así mismo, el empleo de aplicaciones como Excel, que no admiten archivos muy grandes es engorroso con esta gran cantidad de datos. Póngase en contacto con Cimmyt-mab-seed@cgiar.org para obtener ayuda adicional con el acceso o el trabajo con cualquiera de estos archivos de datos genotípicos.


    Disponibilidad

    Conjuntos de datos genotípicos en Dataverse:https://data.cimmyt.org/dataverse/seedsofdiscoverydvn?q=%28keywordValue%3AZea+keywordValue%3Amays%29

    Conjuntos de datos de frecuencia de alelos en Germinate: http://germinate.cimmyt.org/maize/#allele-freq-dataset
    Conjuntos de datos de SNP en Germinate: Disponible en Noviembre 2017.

    Mapas de marcadores en Germinate (http://germinate.cimmyt.org/maize/#map-details)

    Para más información

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CARTERA DE INVESTIGACIÓN

CARTERA DE INVESTIGACIÓN

Recursos genéticos

Recursos genéticos

Desarrollo de capacidades

Desarrollo de capacidades

Datos

Datos

Germoplasma de pre-reproducción

Germoplasma de pre-reproducción

Conocimiento

Conocimiento

Software

Software

  • Recursos genéticos
  • Desarrollo de capacidades
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  • Germoplasma de pre-reproducción
  • Conocimiento
  • Software
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  • Germoplasma de pre-reproducción
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FILOSOFÍA DE NUESTRO ENFOQUE

FILOSOFÍA DE NUESTRO ENFOQUE

¡Tantas accesiones, tan pocos datos!

Muchos bancos de germoplasma se asemejan a bibliotecas que carecen de catálogos suficientemente informativos. El avance de las plataformas de secuenciación de ADN de siguiente generación ha permitido caracterizar la diversidad genética conservada en bancos de germoplasma completos.

Gestión de la información

Generar nuevos datos por sí mismo es insuficiente si no pueden ser difundidos, consultados, resumidos, visualizados y analizados de manera efectiva. La generación de datos, por lo tanto, tiene que ir de la mano con el suministro de programas computacionales intuitivos y herramientas de análisis para hacer frente a la rápida expansión de datos que describen los recursos genéticos de maíz y trigo.

Pre-mejoramiento

Un “re arreglo” de la diversidad de los bancos de germoplasma en un formato más accesible para los mejoradores podría reducir las barreras para movilizar nuevas variaciones genéticas en programas de mejoramiento, que en buena parte se deben a la dependencia de los efectos génicos en la dotación genética de los diferentes materiales a mejorar.

Rasgos con arquitectura genética compleja

Algunos de los desafíos más importantes para la agricultura deben ser abordados manipulando caracteres genéticamente complejos controlados por alelos de efecto menor (potencial de rendimiento, tolerancia al calor y sequía, etc.).

Recolección de germoplasma

La disponibilidad de un número suficiente de accesiones en los bancos de germoplasma no parecen ser un factor que limite el uso de nuevas variaciones genéticas en los programas de mejoramiento y una nueva iniciativa garantizará la red global de bancos de germoplasma de los principales cultivos alimentarios para las generaciones futuras.