NOVEDADES

  • Colaboran Agricultura y CIMMYT en mejorar las variedades de maíz, con mayor resistencia al clima, plagas y enfermedades

    El Atlas Molecular del Maíz es uno de los trabajos científicos más relevantes de la actualidad, con lo cual se han caracterizado más de 42 mil muestras de maíz (incluyendo 24 mil de maíces nativos) y se han generado más de 50 billones de datos útiles para encontrar variedades resistentes a calor, sequía, plagas y enfermedades. NÚM. 374 / Ciudad de México El Atlas Molecular del Maíz es uno de los trabajos científicos más relevantes de la actualidad, con lo cual se han caracterizado más de 42 mil muestras de maíz (incluyendo 24 mil de maíces nativos) y se han generado más ...

  • Taller "Fenotipificación de trigo"

    El Centro Internacional de Mejoramiento de Maíz y Trigo (CIMMYT) extiende una cordial invitación para participar en el taller de “Fenotipificación de trigo para la identificación de germoplasma con alto potencial de rendimiento y tolerancia a sequía y calor”, a realizarse en el marco del II Plant Breeding Symposium México ( https://trasmejoragen.wixsite.com/inicio) 2018 en CIMMYT, Texcoco, Estado de México, el día 28 de septiembre de 2018 a las 9:00 hrs. (De 9:00 a 14:00 hs) El objetivo de este taller es capacitar a los participantes en la caracterización fenotípica del germoplasma de trigo. Los ejes temáticos son: cambio climático, características prioritarias ...

  • II Plant Breeding Symposium México 2018

    MasAgro Biodiversidad anuncia el II Plant Breeding Symposium México 2018 el cual se llevará a cabo los días 6 y 7 de septiembre de 2018 en las instalaciones de CIMMYT, Texcoco. México. Este evento pertenece a la serie de simposios organizados por DuPont Pioneer. Para mayor información por favor visite el sitio web: https://trasmejoragen.wixsite.com/inicio

  • Convocatoria Investigación MasAgro para análisis genético

    En el marco del programa de Modernización Sustentable de la Agricultura Tradicional (Programa MasAgro), desarrollado por la Secretaría de Agricultura y Desarrollo Rural (SADER), y a través de su línea de acción MasAgro Biodiversidad liderada por el Centro Internacional de Mejoramiento de Maíz y Trigo (CIMMYT) el cual tiene como uno de sus objetivos el aprovechamiento de los recursos genéticos valiosos, mediante tecnologías de punta y desarrollo de capacidades, para acelerar el desarrollo (la obtención) de variedades de maíz y trigo de alto rendimiento, estables y tolerantes al cambio climático. Una de las actividades contempladas es la difusión de los ...

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Catalogo

CATALOGO DE PRODUCTOS

CATALOGO DE PRODUCTOS

MasAgro Biodiversidad, un componente del programa Modernización Sustentable de la Agricultura Tradicional (MasAgro), se enfoca en el aprovechamiento y conservación de recursos genéticos valiosos mediante el uso de la diversidad genética resguardada en los bancos de germoplasma, con el propósito de acelerar el desarrollo de variedades de maíz y trigo que puedan satisfacer la demanda alimenticia y nutricional de una población creciente, ante los desafíos del cambio climático.

Mediante la caracterización de la configuración genética de las colecciones del banco de germoplasma del CIMMYT, la evaluación de características prioritarias – como la tolerancia a sequía, altas temperaturas y algunas enfermedades – y el desarrollo de herramientas de bioinformática que agilizan su análisis, MasAgro Biodiversidad ha generado una “plataforma para la utilización de recursos genéticos” de maíz y trigo.

Esta plataforma pone varios productos a disposición de la comunidad científica. MasAgro Biodiversidad además ofrece algunos servicios con la finalidad de promover la equidad en el acceso y beneficios del uso de la diversidad del maíz y el trigo.

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  • Datos Fenotípicos de Trigo


    El proyecto Seeds of Discovery ha generado varios tipos de datos fenotípicos describiendo germoplasma de trigo, incluyendo accesiones del Banco de Germoplasma del CIMMYT (BGC), cruzamientos triples y materiales de pre-mejoramiento generados a partir de materiales del BGC. Los ensayos se han llevado a cabo en condiciones óptimas, condiciones de estrés abiótico incluyendo sequía y calor, y condiciones de estrés biótico, incluyendo roya amarilla.

    Detalles del producto y características

    En los ensayos de campo se han capturado rutinariamente características estándar tales como el rendimiento, días a floración y madurez, y altura de planta. Se han registrado características adicionales, tales como características morfológicas de las espigas, en ensayos especializados. Características de calidad del trigo, como la proteína de grano y la incidencia de granos amarillos de grano, también se han medido para el germoplasma seleccionado.

    Los datos fenotípicos se publican en el repositorio Dataverse que almacena archivos planos y/o el almacén de datos Germinate que almacena los resultados fenotípicos y permite vincular estos datos a datos genotípicos adicionales e información sobre germoplasma. En general, los resultados analizados para cada experimento se liberan como conjuntos de datos individuales dentro de Germinate. Los datos fenotípicos se liberan principalmente en Dataverse cuando se requieren archivos adicionales de apoyo o explicaciones de las condiciones experimentales.

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  • Conjuntos de datos fenotípicos en Germinate:

    1. Está disponible una lista de conjuntos de datos fenotípicos en el almacén de datos Germinate junto con enlaces a conjuntos de datos individuales.Link
    2. Cada conjunto de datos está disponible para descarga directa en un formato de texto simple que incluye identificadores de germoplasma, nombres y unidades de características y valores fenotípicos.
    3. Los datos fenotípicos también se pueden generar dinámicamente de varias maneras, tales como:
      • Los usuarios pueden realizar búsquedas en todos los datos fenotípicos y filtrar los datos seleccionados en base a varios criterios, incluyendo ID de germoplasma, nombre de la variable, valores de la variable y descripción de los datos.
      • Los usuarios pueden generar “Grupos” de germoplasma usando una o más herramientas de búsqueda o filtrado y usarlos para recuperar datos fenotípicos de uno o más ensayos.
      • Los usuarios pueden descargar características seleccionados de cualquier ensayo o conjunto de ensayos.
    4. Los datos fenotípicos de uno o más ensayos también se pueden visualizar en gráficas que permiten seleccionar subconjuntos de germoplasma basándose en sus valores fenotípicos.

    1. Los archivos de datos fenotípicos se pueden exportar en un formato para ser usado en el software Flapjack, donde pueden combinarse con datos genotípicos.

    Conjuntos de datos fenotípicos en Dataverse:

    1. Está disponible una lista de conjuntos de datos fenotípicos para descarga en el repositorio de Dataverse con enlaces a estudios individuales.Link
    2. Los estudios contienen archivos de datos estáticos, incluyendo archivos de resultados fenotípicos, y archivos de apoyo, como mapas de campo, hojas de gestión, datos meteorológicos, protocolos de fenotipificación y otros documentos relevantes.
    3. Cada estudio esta descrito por metadatos estándares, incluyendo: nombre del estudio, descripción, autores, generador(es) de datos, fecha de generación, palabras clave, términos del Ontología de Cultivos (Crop Ontology) para características, enlaces a estudios relacionados, y enlaces a artículos científicos relevantes.

    Comentarios

    Los conjuntos de datos fenotípicos en Germinate contienen principalmente BLUPs analizados, pero es importante utilizar la descripción del conjunto de datos para determinar el tipo de datos (crudos o analizados) y las condiciones y tratamientos aplicados en el ensayo. Póngase en contacto con Cimmyt-mab-seed@cgiar.org para obtener ayuda adicional para trabajar con cualquiera de estos archivos.

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  • Usuarios principales

    Pre-mejoradores de trigo, investigadores, estudiantes que trabajan en campos relevantes como biología, mejoramiento y bioinformática, así como curadores de bancos de germoplasma y usuarios de materiales del banco de germoplasma del CIMMYT.

     

    Disponibilidad

    Conjuntos de datos fenotípicos en Germinate: http://germinate.cimmyt.org/wheat/#categorical-datasets

    Conjuntos de datos fenotípicos en Dataverse: https://data.cimmyt.org/dataverse/seedsofdiscoverydvn?q=keywordValue%3Awheat

     

    Para mayor información

     

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CARTERA DE INVESTIGACIÓN

CARTERA DE INVESTIGACIÓN

Recursos genéticos

Recursos genéticos

Desarrollo de capacidades

Desarrollo de capacidades

Datos

Datos

Germoplasma de pre-reproducción

Germoplasma de pre-reproducción

Conocimiento

Conocimiento

Software

Software

  • Recursos genéticos
  • Desarrollo de capacidades
  • Datos
  • Germoplasma de pre-reproducción
  • Conocimiento
  • Software
  • Recursos genéticos
  • Desarrollo de capacidades
  • Datos
  • Germoplasma de pre-reproducción
  • Conocimiento
  • Software

FILOSOFÍA DE NUESTRO ENFOQUE

FILOSOFÍA DE NUESTRO ENFOQUE

¡Tantas accesiones, tan pocos datos!

Muchos bancos de germoplasma se asemejan a bibliotecas que carecen de catálogos suficientemente informativos. El avance de las plataformas de secuenciación de ADN de siguiente generación ha permitido caracterizar la diversidad genética conservada en bancos de germoplasma completos.

Gestión de la información

Generar nuevos datos por sí mismo es insuficiente si no pueden ser difundidos, consultados, resumidos, visualizados y analizados de manera efectiva. La generación de datos, por lo tanto, tiene que ir de la mano con el suministro de programas computacionales intuitivos y herramientas de análisis para hacer frente a la rápida expansión de datos que describen los recursos genéticos de maíz y trigo.

Pre-mejoramiento

Un “re arreglo” de la diversidad de los bancos de germoplasma en un formato más accesible para los mejoradores podría reducir las barreras para movilizar nuevas variaciones genéticas en programas de mejoramiento, que en buena parte se deben a la dependencia de los efectos génicos en la dotación genética de los diferentes materiales a mejorar.

Rasgos con arquitectura genética compleja

Algunos de los desafíos más importantes para la agricultura deben ser abordados manipulando caracteres genéticamente complejos controlados por alelos de efecto menor (potencial de rendimiento, tolerancia al calor y sequía, etc.).

Recolección de germoplasma

La disponibilidad de un número suficiente de accesiones en los bancos de germoplasma no parecen ser un factor que limite el uso de nuevas variaciones genéticas en los programas de mejoramiento y una nueva iniciativa garantizará la red global de bancos de germoplasma de los principales cultivos alimentarios para las generaciones futuras.