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Taller – GWAS (Estudios de asociación del genoma completo)
El taller de estudios de asociación del genoma completo (GWAS) se enfoca en modelos y métodos genómicos y su aplicación en el mejoramiento. El taller utiliza un fuerte componente práctico con ejercicios de computadora usando un conjunto de datos reales de una variable agronómica compleja.Detalles del producto y características
Para aprovechar este taller e implementar GWAS, el usuario debe tener:
- Conocimientos básicos de computación.
- Nivel moderado de calidad de su computadora.
- Programa R instalado.
- El participante debe estar familiarizado con el lenguaje de programación R.
- Conocimientos básicos de genética y estadística.
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Comentarios
GWAS permite la inferencia estadística práctica para asociar un carácter de interés con las regiones genómicas que lo afectan. Frecuentemente, el análisis GWAS es un paso preliminar hacia el descubrimiento de genes que determinan la expresión del carácter de interés. Después de una introducción a R, los temas a desarrollar durante el taller incluyen el proceso de control de calidad de datos, filtrado de datos, análisis de desequilibrio de ligamiento, métodos para detectar/corregir la estratificación poblacional, estimación del efecto de marcadores, aplicación de correcciones múltiples y la interpretación para variables cuantitativas y binarios.
Disponibilidad
El taller está disponible para el público: http://hdl.handle.net/11529/10294
Usuarios Principales
Investigadores, mejoradores y estudiantes de los sectores público y privado. Se emplea en todas las áreas de la investigación científica que incluyan el uso de grandes conjuntos de datos moleculares para su uso en programas de mejoramiento.
Para mayor información
- Por favor envíenos un mensaje a cimmyt-mab-seed@cgiar.org
NOVEDADES
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El Atlas Molecular del Maíz es uno de los trabajos científicos más relevantes de la actualidad, con lo cual se han caracterizado más de 42 mil muestras de maíz (incluyendo 24 mil de maíces nativos) y se han generado más de 50 billones de datos útiles para encontrar variedades resistentes a calor, sequía, plagas y enfermedades. NÚM. 374 / Ciudad de México El Atlas Molecular del Maíz es uno de los trabajos científicos más relevantes de la actualidad, con lo cual se han caracterizado más de 42 mil muestras de maíz (incluyendo 24 mil de maíces nativos) y se han generado más ...
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MasAgro Biodiversidad anuncia el II Plant Breeding Symposium México 2018 el cual se llevará a cabo los días 6 y 7 de septiembre de 2018 en las instalaciones de CIMMYT, Texcoco. México. Este evento pertenece a la serie de simposios organizados por DuPont Pioneer. Para mayor información por favor visite el sitio web: https://trasmejoragen.wixsite.com/inicio
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En el marco del programa de Modernización Sustentable de la Agricultura Tradicional (Programa MasAgro), desarrollado por la Secretaría de Agricultura y Desarrollo Rural (SADER), y a través de su línea de acción MasAgro Biodiversidad liderada por el Centro Internacional de Mejoramiento de Maíz y Trigo (CIMMYT) el cual tiene como uno de sus objetivos el aprovechamiento de los recursos genéticos valiosos, mediante tecnologías de punta y desarrollo de capacidades, para acelerar el desarrollo (la obtención) de variedades de maíz y trigo de alto rendimiento, estables y tolerantes al cambio climático. Una de las actividades contempladas es la difusión de los ...
