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‘CurlyWhirly’ – visualizador de datos multi-dimensional
Esta aplicación ayuda a visualizar datos multi-dimensionales, con un enfoque particular en los resultados del análisis de coordenadas principales (PCoA) y análisis de componentes principales (PCA). Los datos se pueden observar y también se pueden realizar selecciones aplicando datos adicionales, como los datos categóricos. Es una poderosa herramienta para discriminar germoplasmas similares mediante análisis de distancias genéticas, o incluso para identificar contaminaciones indeseables. CurlyWhirly fue desarrollado por el Instituto James Hutton en colaboración con el CIMMYT.Detalles del producto y características
- CurlyWhirly es una aplicación multidimensional de visualización de datos en espacio 3D.
- Permite rotación, zoom, y una gama de interacciones de puntos. Colorea los puntos por categoría.
- Facilita la visualización de pocos a decenas de miles de puntos de datos. Se puede realizar un filtrado jerárquico de puntos visibles/seleccionados.
- Crea películas y capturas de pantalla.
- Los datos fenotípicos pueden agregarse para ayudar a la interpretación.
- Es posible seleccionar y exportar datos para un análisis posterior.
- Es posible explorar los datos disponibles en el proyecto MasAgro-Biodiversidad.
- Aplicación multi-plataforma disponible públicamente para descarga.
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COMENTARIOS
- Este software visualiza la información genética de una manera global entre las diferentes entradas, proyectando a otro nivel la información capturada por el software Flapjack a nivel del genoma.
Disponibilidad
Liberado con versiones mejoradas que se publican periódicamente con actualización automática: https://ics.hutton.ac.uk/curlywhirly/download-curlywhirly/
Usuarios Principales
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Mejoradores, investigadores, estudiantes de institutos públicos y empresas privadas de semillas que trabajan con diferentes niveles de complejidad de germoplasma.
Para mayor información:
- Por favor envíenos un mensaje a Cimmyt-mab-seed@cgiar.org
NOVEDADES
- Colaboran Agricultura y CIMMYT en mejorar las variedades de maíz, con mayor resistencia al clima, plagas y enfermedades
El Atlas Molecular del Maíz es uno de los trabajos científicos más relevantes de la actualidad, con lo cual se han caracterizado más de 42 mil muestras de maíz (incluyendo 24 mil de maíces nativos) y se han generado más de 50 billones de datos útiles para encontrar variedades resistentes a calor, sequía, plagas y enfermedades. NÚM. 374 / Ciudad de México El Atlas Molecular del Maíz es uno de los trabajos científicos más relevantes de la actualidad, con lo cual se han caracterizado más de 42 mil muestras de maíz (incluyendo 24 mil de maíces nativos) y se han generado más ...
- Taller "Fenotipificación de trigo"
El Centro Internacional de Mejoramiento de Maíz y Trigo (CIMMYT) extiende una cordial invitación para participar en el taller de “Fenotipificación de trigo para la identificación de germoplasma con alto potencial de rendimiento y tolerancia a sequía y calor”, a realizarse en el marco del II Plant Breeding Symposium México ( https://trasmejoragen.wixsite.com/inicio) 2018 en CIMMYT, Texcoco, Estado de México, el día 28 de septiembre de 2018 a las 9:00 hrs. (De 9:00 a 14:00 hs) El objetivo de este taller es capacitar a los participantes en la caracterización fenotípica del germoplasma de trigo. Los ejes temáticos son: cambio climático, características prioritarias ...
- II Plant Breeding Symposium México 2018
MasAgro Biodiversidad anuncia el II Plant Breeding Symposium México 2018 el cual se llevará a cabo los días 6 y 7 de septiembre de 2018 en las instalaciones de CIMMYT, Texcoco. México. Este evento pertenece a la serie de simposios organizados por DuPont Pioneer. Para mayor información por favor visite el sitio web: https://trasmejoragen.wixsite.com/inicio
- Convocatoria Investigación MasAgro para análisis genético
En el marco del programa de Modernización Sustentable de la Agricultura Tradicional (Programa MasAgro), desarrollado por la Secretaría de Agricultura y Desarrollo Rural (SADER), y a través de su línea de acción MasAgro Biodiversidad liderada por el Centro Internacional de Mejoramiento de Maíz y Trigo (CIMMYT) el cual tiene como uno de sus objetivos el aprovechamiento de los recursos genéticos valiosos, mediante tecnologías de punta y desarrollo de capacidades, para acelerar el desarrollo (la obtención) de variedades de maíz y trigo de alto rendimiento, estables y tolerantes al cambio climático. Una de las actividades contempladas es la difusión de los ...
