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  • ‘CurlyWhirly’ – visualizador de datos multi-dimensional


    Esta aplicación ayuda a visualizar datos multi-dimensionales, con un enfoque particular en los resultados del análisis de coordenadas principales (PCoA) y análisis de componentes principales (PCA). Los datos se pueden observar y también se pueden realizar selecciones aplicando datos adicionales, como los datos categóricos. Es una poderosa herramienta para discriminar germoplasmas similares mediante análisis de distancias genéticas, o incluso para identificar contaminaciones indeseables. CurlyWhirly fue desarrollado por el Instituto James Hutton en colaboración con el CIMMYT.

    Detalles del producto y características

    1. CurlyWhirly es una aplicación multidimensional de visualización de datos en espacio 3D.
    2. Permite rotación, zoom, y una gama de interacciones de puntos. Colorea los puntos por categoría.
    3. Facilita la visualización de pocos a decenas de miles de puntos de datos. Se puede realizar un filtrado jerárquico de puntos visibles/seleccionados.
    4. Crea películas y capturas de pantalla.
    5. Los datos fenotípicos pueden agregarse para ayudar a la interpretación.
    6. Es posible seleccionar y exportar datos para un análisis posterior.
    7. Es posible explorar los datos disponibles en el proyecto MasAgro-Biodiversidad.
    8. Aplicación multi-plataforma disponible públicamente para descarga.

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  • Comentarios

    Este software visualiza la información genética de una manera global entre las diferentes entradas, proyectando a otro nivel la información capturada por el software Flapjack a nivel del genoma.

     

    Disponibilidad

    Liberado con versiones mejoradas que se publican periódicamente con actualización automática: https://ics.hutton.ac.uk/curlywhirly/download-curlywhirly/

     

    Usuarios Principales

    Mejoradores, investigadores, estudiantes de institutos públicos y empresas privadas de semillas que trabajan con diferentes niveles de complejidad de germoplasma.

     

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